欢迎来到专业的新思文库网平台! 工作计划 工作总结 心得体会 事迹材料 述职报告 疫情防控 思想汇报 党课下载
当前位置:首页 > 范文大全 > 公文范文 > 正文

沉默HepG2细胞核糖核酸酶抑制因子的shRNA逆转录病毒载体的构建及鉴定

时间:2022-10-17 17:05:04 来源:网友投稿

[摘要] 目的 构建针对人核糖核酸酶抑制因子(hRI)的shRNA逆转录病毒载体,为探讨hRI抗肿瘤作用机制打下基础。 方法 用亚克隆法将目的片段pkd-dsRI和pkd从表达载体pKD-dsRI克隆到pLNCX上,用双酶切筛选得到阳性克隆后,用脂质体法将其转染到人肝癌细胞HepG2细胞中,用800 mg/L G418筛选2周,产生稳定的细胞克隆后,用RT-PCR检测细胞中核糖核酸酶抑制因子mRNA表达的变化。 结果 双酶切鉴定为阳性克隆。RT-PCR表明,对比空白组(0.790±0.014)和空载体组(0.904±0.027),干扰组hri基因表达(0.361±0.048)明显下调,差异有统计学意义(P < 0.05)。 结论 成功构建了针对hRI的shRNA逆转录病毒载体。

[关键词] 人核糖核酸酶抑制因子;shRNA;逆转录病毒载体;构建

[中图分类号] R394.33[文献标识码] A[文章编号] 1673-7210(2014)05(b)-0014-04

Construction and identification of retroviral vector expressing shRNA targeting hRI gene in HepG2 cell

LI Lin1 LI Kun2▲ WANG Fuqiang3 DING Ning2

1.Department of Laboratory Medicine, Maternal and Child Care Service Centre of Dalian City, Liaoning Province, Dalian 116021, China; 2.School of Medicine, Dalian University, Liaoning Province, Dalian 116021,China; 3.Dalian Ocean University, Liaoning Province, Dalian 116021, China

[Abstract] Objective To construct the retroviral vector expressing shRNA targeting hRI gene, in order to provide basis for discussion of hRI antitumor effect. Methods The target fragments of pkd-dsRI and pkd from the vectors of pKD-dsRI were subcloned into the retroviral vector pLNCX respectively. The vector was identified by enzyme digested, then transfected into HepG2 cells with liposome method. After 2 weeks of selection of 800 mg/L G418, the silencing effect of the siRNA plasmid was identified by RT-PCR on the HepG2 cells. Results Restriction enzyme digestion proved that the construction of retroviral vector expressing shRNA targeting hRI gene was correct. RT-PCR showed that the expression of hri gene were significantly reduced in the HepG2 cells transfected with shRNA-hRI retroviral vector (0.361±0.048) as compared with the blank control group (0.790±0.014) and the blank retroviral vector group (0.904±0.027), with statistically significant difference (P < 0.05). Conclusion The retroviral vector expressing shRNA targeting hRI gene is successfully constructed.

[Key words] Human ribonuclease inhibitor; shRNA; Retroviral expression vector; Construction

人核糖核酸酶抑制因子(human ribonuclease inhibitor,hRI)是广泛存在于哺乳动物胞浆内的酸性糖蛋白,基因定位于11p15.5,分子量为50 kD[1-2]。研究发现,hRI是核糖核酸酶(RNase A)的抑制剂(Ki=4.0×10-14 mol/L),能有效抑制RNase A对RNA的水解[3]。hRI还可以与血管生长因子(Angiogenin,Ang)紧密结合(Ki=7.1×10-16 mol/L)而抑制Ang促血管生成的活性[3-4]。此外,hRI还具有抗机体氧化损伤功能[5]。综合国内外的研究,本课题组认为hRI能通过抑制Ang活性而抑制肿瘤新血管生成,对于肿瘤的生长、浸润及转移等过程具有抑制作用,推测其可能为肿瘤抑制基因的候选者之一。

为了证明hRI是否是肿瘤抑制因子,本研究将已构建的针对hRI基因的siRNA表达载体pKD-dsRI[6]的H1 Promotor和MCS区段亚克隆至逆转录病毒载体pLNCX的MCS中,获得有新霉素抗性的干扰载体pLNCX-pKD-dsRI,为下一步探讨hRI抗肿瘤作用及抗肿瘤基因治疗的应用打下基础。

1 材料与方法

1.1 材料

质粒pLNCX、E.coli DH5α由大连大学医学院(以下简称“我院”)生物化学与分子生物学教研室保存;针对人核糖核酸酶抑制因子siRNA表达载体pKD-dsRI(图1)由我院生物化学与分子生物学教研室构建。

图1 siRNA表达载体pKD-dsRI

限制性内切酶、DNA Marker、T4DNA连接酶购自TaKaRa;DNA快速凝胶产物回收试剂盒购自博大泰克公司;琼脂糖、氨苄青霉素和链霉素购自华美生物公司;LB培养基购自Invitrogen/GIBCO;G418和RT-PCR kit购自BBI;CellfectinR购自Invitrogen;Trizol、DEPC H2O购自上海生物工程有限公司;核酸序列分析软件primer 5.0、质粒绘制软件plasmid 2.0。

1.2 方法

1.2.1 重组载体pLNCX-pKD-dsRI的构建及鉴定质粒pLNCX用Hind Ⅲ单酶切质粒pLNCX、Klenow Fragment和dNTP补平、CIAP去除5"-磷酸末端后,用乙醇沉淀法回收得到约6.2 kb的平末端的线性化、去磷酸化的载体大片断。质粒pKD-dsRI用PvuⅡ酶切后,经1%琼脂糖电泳切胶回收,获得目的片断(H1 Promotor-dsRI);同样处理pKD,获得目的片断(H1 Promotor-MCS)。载体与片段用T4 DNA连接酶连接、转化后,获得重组载体pLNCX-pKD-dsRI。用BamHⅠ和XhoⅠ双酶切pLNCX-pKD-dsRI,筛选得到正向连接的阳性克隆。挑取单克隆,提取质粒,用BamHⅠ和XhoⅠ双酶切pLNCX-pKD-dsRI,筛选得到正向连接的阳性克隆。将酶切筛选阳性克隆送TaKaRa测序鉴定。

1.2.2 HepG2细胞培养和转染细胞用DMEM培养基进行培养,补加0.03%谷氨酰胺,0.2% NaHCO3,0.59% Hepes(pH 7.2), 10%热灭活(56℃,30 min)的胎牛血清及双抗(青霉素和链霉素各100 U/mL),培养条件为5%的CO2,培养温度37 ℃。细胞按4×104个/孔铺板于24孔板,至90%~95%汇片时,按CellfectinR说明书转染并分组:①空白组(正常细胞);②空载体组(pLNCX-pKD载体转染组);③干扰组(pLNCX-pKD-dsRI载体转染组),每组2复孔。每组质粒共用0.8 μg、脂质体2 μL,转染后24 h,换成含600 μg/mL G418的培养基培养选择2周,挑取G418的抗性单克隆,繁殖、扩增。

1.2.3 mRNA转录水平的检测采用Trizol试剂分别提取各孔中细胞的总RNA。使用RT-PCR试剂盒按照两步法进行RT-PCR反应。以总RNA逆转录合成的cDNA为模板进行PCR反应。用于检测内源表达的RT-PCR引物:5"-gacatccagtgtgaggagctgagcg-3",5"-ccagcctcattgatgtcgttgttgc-3",上游引物位于hri基因的No.27 bp,下游引物位于hri基因的No.559 bp,产物长度约为527 bp。β-actin引物 5"- gctgtccctgtacgcctctg-3",5"-tgccgatggtgatgacctgg-3",产物长度约为300 bp。由Bio-Rad凝胶成像仪摄取图像,Image LabTM软件对各个条带测定其面积及灰度值。用目的基因条带灰度值与β-actin条带灰度值的比值表示目的基因的相对表达强度。干扰率=(相对表达强度空载体组-相对表达强度干扰组)/相对表达强度空载体组。

1.3 统计学方法

采用统计软件SPSS 11.5统计学软件进行数据分析,计量资料数据用均数±标准差(x±s)表示,多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用LSD-t检验,以P < 0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 重组载体pLNCX-pKD-dsRI的构建及鉴定

2.1.1 重组载体pLNCX-pKD-dsRI的构建质粒pKD-dsRI用PvuⅡ酶切后获得约618 bp的目的片断pkd-dsRI;同样处理pKD,获得约534 bp的目的片断pkd(图2)。质粒pLNCX用HindⅢ单酶切质粒pLNCX、Klenow Fragment和dNTP补平和CIAP去除5"-磷酸末端后,回收得到约6.2 kb的平末端的线性化、去磷酸化载体大片断(图3)。

M1:DL2000 Marker;1:pKD-dsRI/PVUⅡ;2:pKD/PVUⅡ

图2 质粒pKD-dsRI、pKD单酶切电泳图

M1:λ-EcoT14 Ⅰdigested DNA Marker;1:pLNCX/HindⅢ

图3 质粒pLNCX单酶切电泳图

2.1.2 酶切鉴定阳性重组质粒pLNCX-pKD-dsRI-Neor和pLNCX-pKD-Neor用BamHⅠ和XhoⅠ双酶切pLNCX-pKD-dsRI,得到5523 bp和1305 bp两条片段(图4);同样处理pLNCX-pKD-dsRI,得到5523 bp和1221 bp两条片段(图5)。

M1:DL2000 Marker;M2:λ-EcoT14Ⅰdigested DNA Marker;1:pLNCX-pKD-neor/BamHⅠ+XhoⅠ

图4 pLNCX-pKD-dsRI-neor双酶切电泳图

M1:DL2000 Marker;M2:λ-EcoT14Ⅰdigested DNA Marker;1:pLNCX-pKD-dsRI-neor/BamHⅠ+ XhoⅠ(5523 bp和1221bp);2:plasmid of pLNCX-pKD-neor

图5 pLNCX-pKD-neor双酶切电泳图

2.2 mRNA转录水平的检测

RT-PCR结果显示,空白组hri基因的相对表达强度为0.790±0.014,空载体组的相对表达强度为0.904±0.027,干扰组的相对表达强度为0.361±0.048。与空白组和空载体组对比,干扰组中hri基因均显著下调(P < 0.05),抑制率大于80%。可见,hri基因在转录后水平上分别被沉默(图6)。

M:DL2000 Marker;1:空白组中β-actin的表达;2:空白组中hri基因的表达;3:空载体组中β-actin的表达;4:空载体组中hri基因的表达;5:干扰组中hri基因的表达被干扰;6:干扰组中β-actin的表达

图6 RT-PCR检测转染hri基因在HepG2细胞中的表达

3讨论

RNA干扰(RNA interference,RNAi)是双链RNA(double-strand RNA,dsRNA)介导的序列特异的转录后基因沉默(posttranscriptional gene silencing, PTGS)现象。2001年Elbashir等[7]证明合成的双链siRNA在哺乳动物细胞中可实现靶基因特异沉默作用,由此RNAi被广泛用于特异基因的生物学功能的研究。目前常用的siRNA的制备方法有化学合成法、体外转录法、RNase Ⅲ消化法、siRNA质粒表达载体法、siRNA表达盒细胞内表达法等[8],其中,质粒载体表达siRNA法,最常利用哺乳动物细胞启动子RNA聚合酶Ⅲ依赖的启动子如鼠和人U6-snRNA启动子、人RNase P(H1)启动子、人Val-tRNA启动子等调控表达siRNA或shRNA,但存在转染效率低等问题。由于逆转录病毒载体能将外源基因有效地整合到宿主细胞基因组中,并随细胞分裂而传给后代,所以使用逆转录病毒载体转染可以获得长期稳定的RNA干扰效果[9]。如Clontech的RNAi-Ready pSIREN-RetroQ-DsRed-Express[10]、Oligoengine的pSUPER retro[11]、TaKaRa的pSINsi系列载体、Ambion公司的pSilencerTM 5.1 Retro[12]等。基于2002年Xia[13]等报道,细胞内RNA聚合酶Ⅱ依赖的启动子也能高效表达siRNA,Ambion公司的RNAi载体pSilencerTM 4.1-CMV neo利用改良Cytomegalomavirus (CMV)启动子表达shRNA,也实现了稳定RNA干扰作用。

本研究在瞬时载体pKD-dsRI基础上,将pKD的H1 promoter及其下游的MCS序列亚克隆至逆转录病毒pLNCX的MCS中,得到耐受新霉素的稳定表达沉默hRI的载体pLNCX-pKD-dsRI-neor。双酶切鉴定及在HepG2细胞内RT-PCR结果表明了干扰hRI基因的稳定表达载体构建成功。这为以后研究hRI基因的抗肿瘤作用及在基因治疗中的应用奠定了基础。

[参考文献]

[1]崔秀云,田余祥.核糖核酸酶抑制因子的研究[J].生命的化学,1995,15:24-25.

[2]Schneider R,Higgins MJ,Kieninger D,et al. The human ribonuclese angiogenin inhibitor is encoded by a gene mapped to chromosome 11p15.5,within 90kb of the H-RAS protooncogene [J]. Cytogenet Cell Gene,1992,59:264-267.

[3]Lee F,Shapiro R,Vallee BL. Tight-Binding inhibition of angiogenin and ribonuclease a by placental ribonuclease inhibitor [J]. Biochemistry,1988,28(1):225-227.

[4]Lee FS,Auld DS,Vallee BL. Tryptophan fluorescence as a probe of placental ribonuclease inhibitor binding to angiogenin [J]. Biochemistry,1989,28(1):219-224.

[5]潘东宁,傅攀峰,王红,等.核糖核酸酶抑制因子对H2O2损伤的大鼠神经胶质瘤细胞系C6的影响[J].中国生物化学与分子生物学报,2002,18(6):767-771.

[6]李坤,田余祥,陈海波,等.重组人核糖核酸酶抑制因子基因的siRNA表达载体构建及B16细胞中基因沉默的鉴定[J].应用与环境生物学报,2007,13(4):519-522.

[7]Elbashir SM,Harborth J,Lendeckel W,et al. Duplexes of 21-nucleotide RNAs mediate RNA interference in cultured mammalian cells [J]. Nature,2001,411:494-498.

[8]刘苏虎,张镁,张王刚.在哺乳动物细胞中用于表达干扰RNA的启动子[J].医学分子生物学杂志,2004,1(3):175-177.

[9]Franceschini IA,Feigenbaum-Lacombe V,Casanova P,et al. Efficient gene transfer in mouse neural precursors with a bicistronic retroviral vector [J]. J Neurosci Res,2001,65(3):208-219.

[10]Zhang J,Liu W,Liu J,et al. G-protein β2 subunit interacts with mitofusin 1 to regulate mitochondrial fusion [J]. Nat Commun,2010,1:101.

[11]尹志华,任彩萍,李峰,等.利用报道基因检测鼻咽癌细胞的RNA干扰作用[J].癌症,2005,24(3):371-375.

[12]尹昌林,吕胜青,黄轶,等.pSiRNA-Notch1逆转录病毒载体的构建及对恶性脑胶质瘤细胞的作用[J].第三军医大学学报,2007,29(12):1211-1214.

[13]Xia H,Mao Q,Paulson H,et al. siRNA-mediated gene silencing in vitro and in vitro [J]. Nat Biotechnol,2002,20:1006-1010.

(收稿日期:2014-02-27本文编辑:程铭)

[基金项目] 辽宁省教育厅科学研究一般项目(编号L2011219);大连大学本科生创新课题(编号2013108)。

[作者简介] 李琳(1974-),硕士,副主任检验师;研究方向:分子生物学。

▲通讯作者

推荐访问:逆转录 核糖核酸 因子 载体 抑制