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致病性副溶血性弧菌特异性三重,PCR检测方法研究

时间:2022-10-21 16:20:07 来源:网友投稿

材料与方法

1.1供试菌株副溶血性弧菌标准菌株ATCC 33847,购于中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)。

1.2主要仪器和试剂2720 Thermal Cycler PCR仪、BIO-RAD Sub-Cell GT 型电泳仪、HIR AYAMA HVE-50高压蒸汽灭菌器、BSC-1000ⅡA2生物安全柜、Gel DocTM XR 170-8170凝胶成像分析系统、Eppendorf Centrifuge 5424高速离心机、HS-800D恒温水浴锅等。

Taq DNA 聚合酶、dNTP、DNA Marker DL2000、10×PCR Buffer、细菌基因组DNA提纯试剂盒,均购自上海生工生物工程有限公司。

1.3引物以副溶血性弧菌gyrase、tdh、toxR为靶基因,利用DNAman软件设计引物[14-16],引物由上海生工生物工程有限公司合成,其序列见表1。

1.4副溶血性弧菌DNA模板的制备取纯培养菌株接种于3% NaCl碱性蛋白胨水,(37±1)℃培养18 h。吸取表层菌液1 mL放入1.5 mL无菌离心管中,8 000 r/min离心5 min,弃上清,無菌双蒸水清洗2次,弃上清,然后用细菌基因组DNA纯化试剂盒提取副溶血性弧菌的基因组DNA。

1.5单一及三重PCR反应体系的建立用gyrase、tdh、toxR这3种基因设计的特异性引物分别对副溶血性弧菌ATCC 33847标准菌株的模板DNA进行单一扩增;再用上述3种引物同步对模板DNA进行扩增,通过对PCR各循环参数和各试剂浓度等进行优化,筛选出三重PCR反应的最佳反应条件。

2结果与分析

2.1单重PCR扩增条件的确定以副溶血性弧菌ATCC 33847标准菌株DNA为模板,分别用gyrase、tdh、toxR这3种基因的特异性引物进行扩增,确定了各自PCR的最佳反应条件。

副溶血性弧菌gyrase靶基因PCR反应条件:95 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,59 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,30个循环;72 ℃ 10 min。25.00 μL反应体系:ddH2O 17.75 μL,引物各0.25 μL,模板DNA 2.00 μL,10×PCR Buffer 2.50 μL,dNTP 2.00 μL,Taq酶0.25 μL。

副溶血性弧菌tdh靶基因PCR反應条件:95 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,59 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,30个循环;72 ℃ 10 min。2500 μL反应体系:ddH2O 17.75 μL,引物各0.25 μL,模板DNA 2.00 μL,10×PCR Buffer 2.50 μL,dNTP 2.00 μL,Taq酶0.25 μL。

副溶血性弧菌toxR靶基因PCR反应条件:95 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,30个循环;72 ℃ 10 min。2500 μL反应体系:ddH2O 17.75 μL,引物各0.25 μL,模板DNA 2.00 μL,10×PCR Buffer 2.50 μL,dNTP 2.00 μL,Taq酶0.25 μL。

gyrase、tdh和toxR 均扩增出清晰条带,大小分别与预期的91、269、368 bp 结果相符(图1)。

2.2三重 PCR 反应条件的确定在单重PCR研究的基础上,对三重PCR反应体系条件进行优化,确定最佳反应条件:95 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,56.5 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,30个循环;72 ℃ 10 min。最佳反应体系(25.00 μL):模板DNA 2.00 μL,10 μmol/L gyrase基因的上下游引物各0.25 μL,10 μmol/L tdh基因的上下游引物各0.50 μL,10 μmol/L toxR基因的上下游引物各0.75 μL,10×PCR Buffer 2.50 μL,dNTP 2.50 μL,Taq酶0.50 μL,补充ddH2O至25.00 μL。

在最佳反应条件下,三重PCR扩增的目的条带与预期结果相符(图2)。

3结论

该试验以副溶血性弧菌的保守基因gyrase与特异性致病基因tdh、toxR为靶基因,设计了3对特异性引物,分别进行3种基因单一及三重PCR检测,结果以gyrase、tdh、toxR基因为单一靶基因分别可以扩增出91、269、368 bp条带;同时,通过优化3种靶基因的引物浓度、引物间比例以及退火温度,建立了在1个反应管中同步扩增3种目标基因的三重PCR检测方法。该研究建立的三重PCR检测方法可用于快速检测水产品中的致病性副溶血性弧菌,对提高应对因副溶血性弧菌污染而引起的食品安全事故的响应速度,加强水产品副溶血性弧菌污染状况应急监测具有重要意义。

参考文献

[1] 石椿丽.从进境的海产品中检出副溶血性弧菌[J].福建畜牧兽医,2010,32(3):4-5.

[2] 何玉芳,裘伟康,郭智成,等.杭州市不同样品中副溶血性弧菌污染状况检测[J].中国公共卫生,2007,23(6):745-746.

[3] YAMAZAKI W,ISHIBASHI M,KAWAHARA R,et al.Development of a loopmediated isothermal amplification assay for sensitive and rapid detection of Vibrio parahaemolyticus[J].BMC Microbiology,2008,8(1):163.

[4] 李晓虹,闫东丽.利用多重PCR检测食品中副溶血性弧菌的方法研究[J].中国卫生检验杂志,2007,17(11):1975-1977.

[5] JONES J L,VICKERY M C,BLACKSTONE G M,et al.Development of a multiplex realtime PCR assay with an internal amplication control for the detection of total and pathogenic Vibrio parahaemolyticus bacteria in oystera[J].Applied and environmental microbiology,2007,73(18):5840-5847.

[6] CAI T X,JIANG L Y,YANG C B,et al.Application of realtime PCR for quantitative detection of Vibrio parahaemolyticus from seafood in eastern China[J].FEMS Immunology and Medical Microbiology,2006,46(2):180-186.

[7] 中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会.食品微生物学检测 副溶血性弧菌检验:GB/T 4789.7—2013[S].北京:中国标准出版社,2013.

[8] 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局,中国国家标准化管理委员会.饲料中副溶血性弧菌的检测:GB/T 26426—2010[S].北京:中国标准出版社,2010.

[9] 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局.进出口食品中副溶血性弧菌检测方法:SN/T 0173—2010[S].北京:中国标准出版社,2010.

[10] 黄晨阳,于龙,兰智杰,等.基于toxR基因的PCR检测副溶血性弧菌的方法建立[J].河南预防医学杂志,2013,24(5):327-330.

[11] 岳友宏,苏良.双重PCR检测副溶血性弧菌的tlh和tdh基因方法建立与初步应用[J].实用预防医学,2012,19(9):1413-1415.

[12] 陈丽萍,刘忠民,陈芸,等.特异性三重PCR快速检测副溶血性弧菌[J].微生物学通报,2014,41(4):764-775.

[13] 黄晓蓉,吕海沧,郑晶,等.副溶血弧菌的多重PCR检测[J].食品科学,2006,27(10):445-446.

[14] 中華人民共和国国家质量监督检验检疫总局.进出口食品中副溶血性弧菌快速及鉴定检测方法 实时荧光PCR方法:SN/T 2424—2010[S].北京:中国标准出版社,2010.

[15] FDA.Bacteriological analytical manual online chapter 9[S].Seventh Edition.American:Food and Drug Administration,2004.

[16] KIM Y B,OKUDA J,MATSUMOTO C,et al.Identification of Vibrio parahaemolyticus strains at the species level by PCR targeted to the toxR gene[J].Journal of clinical microbiology,1999,37(4):1173-1177.安徽农业科学,Journal of Anhui Agri. Sci.2017,45(14):141-143,170

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